公司过年请假不发年终奖的处理，存在以下特殊情况或例外情形：
1. 公司制度经民主程序制定且公示：若公司规章制度明确“过年请假（含事假）超过X天不发年终奖”，且该制度经职工代表大会或全体职工讨论、与工会或职工代表平等协商确定，并通过内部邮件、公告栏等方式公示，同时内容合理（如请假天数标准未明显过高），则公司据此不发年终奖可能合法；
2. 员工自愿放弃年终奖：若员工因个人原因长期请假，与公司协商一致自愿放弃当年度年终奖，并签署书面协议，公司不发年终奖合法；
3. 年终奖与绩效直接挂钩：若年终奖本质是绩效奖金，且公司制度明确“请假导致绩效不达标则无奖金”，同时绩效标准合理、考核流程透明，员工因请假未完成绩效目标，公司不发年终奖可能合法。
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针对“年假通常不扣年终奖”的直接回复，可从以下法律依据进行分析：
《中华人民共和国劳动法》第四十七条规定：“用人单位根据本单位的生产经营特点和经济效益，依法自主确定本单位的工资分配方式和工资水平。”但《职工带薪年休假条例》第二条明确：“机关、团体、企业、事业单位、民办非企业单位、有雇工的个体工商户等单位的职工连续工作1年以上的，享受带薪年休假。单位应当保证职工享受年休假。职工在年休假期间享受与正常工作期间相同的工资收入。”
员工依法享受的年假是法定休息休假权利，年终奖虽属用人单位自主分配范畴，但需符合法律规定与合同约定。若员工合法休年假，公司以请假为由扣发年终奖，违反《职工带薪年休假条例》中“年休假期间工资收入不变”的精神，也侵犯了员工的劳动报酬权与休息休假权，故此类情形不合法。
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关于公司过年请假不发年终奖是否合法的问题，需结合具体情况判断。
过年请假不必然导致不发年终奖，是否合法需分情况讨论：
1. 若员工请的是法定年假，且符合公司年假申请流程（如提前申请并获批准），公司以此不发年终奖不合法，因年假是法定福利，不应影响年终奖发放；
2. 若员工请的是事假，且公司规章制度明确规定“事假超过X天不发年终奖”，同时该制度经民主程序制定并公示、内容合理，公司据此不发年终奖可能合法；
3. 若劳动合同或公司制度未明确请假与年终奖挂钩，公司单方面以过年请假为由不发年终奖不合法。
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公司过年请假不发年终奖可能存在以下法律风险点：
1. 劳动报酬权被侵害风险：例如，员工合法休年假后，公司以“过年请假”为由扣发年终奖，导致员工劳动报酬减少，违反《劳动法》第五十条“工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资”的规定；
2. 诉讼时效风险：若员工未在年终奖发放争议发生后1年内申请劳动仲裁，根据《劳动争议调解仲裁法》第二十七条，仲裁机构可能不予受理，员工将无法通过法律途径追回被扣的年终奖。

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